تفاصيل الوثيقة

نوع الوثيقة : رسالة جامعية 
عنوان الوثيقة :
عزل و توصيف جينات الضراوة في فيروسات الروبيان في المملكة العربية السعودية
ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF VIRULENT GENES IN SHRIMP VIRUSES IN SAUDI ARABIA
 
الموضوع : كلية العلوم 
لغة الوثيقة : العربية 
المستخلص : تعتبر صناعة الربيان من أهم القطاعات في المملكة العربية السعودية والذي تنامى الإنتاج فيها بشكل ملحوظ إضافة الى القيمة الاقتصادية الجيدة التي أضافها الاستثمار في هذا القطاع. يعتبر فيروس ظاهرة البقعة البيضاء من أهم الكائنات الدحية الدقيقة الممرضة والتي تسبب النقوق في الروبيان والتي تصل نسبته الى 100% مع تسببه في خسائر اقتصادية في معظم دول العالم. يوجد في المملكة العربية السعودية نوعين من الروبيان تم استزراعها بشكل واسع وهي الفينيروبينس إنديكس والليتوبينس فانامي. تسبب التوسع الهائل في صناعة استزراع الروبيان إلى ظهور فيروس ظاهرة البقعة البيضاء في النوع المستزرع الفينيروبينس إنديكس ونتج عن ذلك تفشي وباء طال جميع مزارع استزراع الروبيان في المملكة العربية السعودية مع اتخاذ كافة تدابير الأمن الحيوي والذي نفذته وزارة البيئة والمياه والزراعة. إن فيروس ظاهرة البقعة البيضاء هو عبارة عن كائن حي دقيق ممرض وضراوته عالية تصيب عدد كبير من القشريات مثل السلطعون وجراد البحر. تهدف دراستنا الحالية الى الكشف عن وجود فيروس ظاهرة البقعة البيضاء في الروبيان المستزرع (الفينيروبينس إنديكس والليتوبينس فانامي) في منطقة مختارة من المملكة العربية السعودية مع عزل أهم جينات الضراوة لفيروس ظاهرة البقعة البيضاء التركيبية والغير تركيبية مثل rr1, rr2, VP28, VP26 وذلك باستخدام طرق التشخيص الجزيئي. تم تجميع العينات من منطقة جازان ثم تثبيتها في محلول ايثانول 95% ومن ثم حفظها في درجة حرارة -80 درجة مئوية الى وقت التحليل. تم استخلاص الحمض النووي من العينات التي تم تجميعها ومن ثم فحصها بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل التقليدي والزمن الحقيقي وذلك للكشف عن وجود فيروس ظاهرة البقعة البيضاء في الربيان المستزرع, تم بعد ذلك تنقية النتيجة الايجابية التي تم الحصول عليها من تفاعل البلمرة المتسلسل وتم تحليل تتابعها النيوكليوتيدي تحتوي تتابعات الجينات التي تم استهدافها مثل VP28و VP26على 615 قاعدة زوجية و 612 قاعدة زوجية من إطار قراءة مفتوح والتي ترمز ل204 و203 من الأحماض الأمينية على التوالي. لا تختلف العزلات السعودية من فيروس ظاهرة البقعة البيضاء لمتواليات الأحماض الأمينية لـ VP26 عن العزلات الأخرى المعروفة في قاعدة بيانات بنك الجينات الدولي. بينما الجين VP28 تأكد لنا وجود حمض أميني واحد مختلف, نتيجة لإحلال G الى D (جلايسين الى حمض الاسبارتيك أسيد). بينما أظهر تحليل النشوء أن الجين VP26 كان له تماثل أكبر مع العزلات الأخرى المعروفة ومع ذلك فان شجرة النشوء أظهرت أن الجين VP28 له تفرع مع السلالات الأخرى المعروفة وخصوصا مع العزلات المصرية والتايلندية. في هذه الدراسة ، كانت هناك محاولة للحصول على الجينات المتعلقة بالضراوة والتي يرمز لها بالوحدة الصغيرة (rr1) والكبيرة (rr2) من الريبونوكليوتيد ردكتاز وذلك من العزلات السعودية لفيروس ظاهرة البقعة البيضاء. لقد تم تجميع العينات للروبيان المستزرع الفينيروبينس إنديكس والليتوبينس فانامي من منطقة جازان وتخزينها في درجة حرارة -80 درجة مئوية للتحليل. لقد قمنا بتأكيد الإصابة بفيروس ظاهرة البقعة البيضاء بواسطة البروتوكول الخاص بمنظمة الصحة الحيوانية. تم تضخيم وتسلسل جينات rr1 عند 2550 قاعدة زوجية وكذلك جينات rr2 عند 1242 قاعدة زوجية وذلك من خلال استخدام بادئات محددة للجين. لقد تم تحديد الوحدات الفرعية للجينات rr1 و rr2 من العزلات وذلك للمرة الأولى. حيث كانت تسلسلات rr1 و rr2 تطابق كبيرة يصل الى (98-100٪) مع التسلسلات الأخرى المعروفة في BLASTX وتمت مطابقة التتابعات مع مجموعة المجال المحفوظة من Ribonucleotide reductase. لقد كشف تحليل النشوء أن تسلسلات العزلات السعودية لفيروس ظاهرة البقعة البيضاء كانت أكثر تجانسًا مع العزلات الأخرى لعائلة الريبونوكليوتيد ردكتاز من فيروس ظاهرة البقعة البيضاء وأنها قد تشكلت كعائلة وحيدة النسل. 
المشرف : د. محمد اشتياق قادري 
نوع الرسالة : رسالة دكتوراه 
سنة النشر : 1441 هـ
2019 م 
تاريخ الاضافة على الموقع : Sunday, December 22, 2019 

الباحثون

اسم الباحث (عربي)اسم الباحث (انجليزي)نوع الباحثالمرتبة العلميةالبريد الالكتروني
علاء الدين حمد حكميHakami, Alaudeen Hamadباحثدكتوراه 

الملفات

اسم الملفالنوعالوصف
 45713.pdf pdf 

الرجوع إلى صفحة الأبحاث